NWChem*

A computational chemistry software package that includes quantum chemical and molecular dynamics functionality.

Performance Increased by up to 1.52x1

NWChem* is designed for high-performance parallel supercomputers and aims to be scalable both in its ability to treat large problems efficiently, and in its usage of available parallel computing resources. It is actively developed by a consortium of developers and maintained by the Environmental Molecular Sciences Laboratory (EMSL) located at the Pacific Northwest National Laboratory (PNNL) in Washington state.

Current support for Intel® Xeon Phi™ coprocessors is included in NWChem* 6.5 or later. The latest development version might contain additional NWChem*
modules with support for the Intel® Xeon Phi™ coprocessor. 

Check the release notes and NWChem* documentation for further information.

Performance Results

NWChem* 6.3rev2 CCSD(T) performed up to 1.35X faster with the Intel® Xeon® processor E5-2697 v2 and the Intel® Xeon Phi™ coprocessor 7120A compared to the Intel® Xeon® processor E5-2697 v2 baseline.

Compared to the NWChem 6.3rev2* and Intel® Xeon® processor E5-2697 v2 baseline, NWChem 6.5 CCSD(T) performed up to 1.52X faster with the Intel® Xeon® processor E5-2697 v2 and the Intel® Xeon Phi™ coprocessor 7120A.

Download the code ›

Reproduce these results with this optimization recipe ›

Configuration Table

System Overview Intel® Xeon® Processor E5-2697 v2 with Intel® Xeon Phi™ Coprocessor 7120A
Platform Intel® R2208GZ4GC platform, 2U chassis, hot-swap drives, 24 DIMMs, 1 750W redundant power supply
CPU/Stepping Intel® Xeon® Processor E5-2697 v2, 2.7 GHz, 12 core, 8 GT/s dual Intel® QuickPath Interconnect (Intel® QPI) links, 130 W, 3.5 GHz max turbo frequency, 768kB instr L1 / 3072kB L2 / 30MB L3 cache
Coprocessor Intel® Xeon Phi™ coprocessor 7110 and 7120; 61 cores, 1.1 and 1.238 GHz, error-correcting code (ECC) enabled, Intel® Turbo Boost Technology disabled. Software details: Intel® Manycore Platform Software Stack (Intel® MPSS) version - 2.1.6720-13/16/19, Flash* version - 2.1.03.0386
Memory Hynix HMT31GR7BFR-PB*, 64 GB total 8*8 GB 1600 MHz Reg ECC DDR3
Chipset Rev 4.6, SE5C600.86B.99.99.x069.071520130923
BIOS BIOS Configuration: default except: Intel® Turbo Boost Technology enabled, Enhanced Intel SpeedStep® Technology enabled, surface-mount technology (SMT) enabled, non-uniform memory access (NUMA) enabled, memory speed 1600 MHz, Note: all prefetchers enabled (this is default)
GigE Node Adapter Intel® Ethernet Controller I350 (rev 01), 4 Gigabit network connections, only one connection in use
IB Switch 36-port switch/rack Mellanox FDR* (model MSX6025F-1BFR), Firmware version:9_2_4002
IB Adapters 36-port switch/rack Mellanox FDR* (model MSX6025F-1BFR), Firmware version:9_2_4002
HDD Specs SEAGATE ST9600205SS* (scsi), 1x600 GB SAS HDD 10kRPM
Operating System Red Hat Enterprise Linux* 6.4

Informacje o produktach i wydajności

1

Wyniki testów uzyskano przed instalacją najnowszych poprawek oprogramowania i aktualizacji oprogramowania sprzętowego, które służą do likwidacji luk w zabezpieczeniach określanych mianem „Spectre” i „Meltdown”. Po zainstalowaniu tych aktualizacji wyniki te mogą nie mieć zastosowania do posiadanego urządzenia lub systemu.

Oprogramowanie i obciążenia wykorzystane w testach wydajności mogły zostać zoptymalizowane pod kątem wydajnego działania tylko na mikroprocesorach Intel®. Testy wydajności, takie jak SYSmark* i MobileMark*, mierzą wydajność określonych systemów komputerowych, komponentów, oprogramowania, operacji i funkcji. Jakakolwiek zmiana wyżej wymienionych czynników może spowodować uzyskanie innych wyników. Aby wszechstronnie ocenić planowany zakup, w tym wydajność danego produktu w porównaniu z konkurencyjnymi, należy zapoznać się z informacjami z innych źródeł oraz innymi testami wydajności. Więcej informacji można znaleźć na stronie http://www.intel.pl/benchmarks.